GEM Japan Large Scale Genomics (LSG)
概要
シークエンシング（塩基配列解読）の高速化に伴い大量の塩基配列データやその派生データが日々産生されており、それらを要領よく保管し活用するためのスタンダードやツールが必要とされている。
このWork Streamでは、大規模なゲノムデータ（塩基配列、遺伝子変異、遺伝子発現のデータ）にリモートアクセスするための標準的なファイル、API（Application Programming Interface）ならびにクラウドを作成している。また、使用者のニーズを適切に反映させるために、シークエンシング機器の会社や関連ソフトウェアの開発会社、さらにはGA4GHのドライバープロジェクトとも緊密に連携している。
Tool Kit（2020年3月時点）
リリース済み
準備中
- Genetic Variation File Formats
参加メンバー
- Oliver Hofmann: Melbourne Medical School, Associate Professor
- Thomas Keane: EMBL-EBI, Team leader
リンク
（記事協力：AMED科学技術調査員 秦千比呂）
最終更新日 令和2年3月19日