GEM Japan Large Scale Genomics (LSG)

概要

シークエンシング(塩基配列解読)の高速化に伴い大量の塩基配列データやその派生データが日々産生されており、それらを要領よく保管し活用するためのスタンダードやツールが必要とされている。
このWork Streamでは、大規模なゲノムデータ(塩基配列、遺伝子変異、遺伝子発現のデータ)にリモートアクセスするための標準的なファイル、API(Application Programming Interface)ならびにクラウドを作成している。また、使用者のニーズを適切に反映させるために、シークエンシング機器の会社や関連ソフトウェアの開発会社、さらにはGA4GHのドライバープロジェクトとも緊密に連携している。

Tool Kit(2020年3月時点)

リリース済み

準備中

  • Genetic Variation File Formats

参加メンバー

  • Oliver Hofmann: Melbourne Medical School, Associate Professor
  • Thomas Keane: EMBL-EBI, Team leader

リンク

(記事協力:AMED科学技術調査員 秦千比呂)

最終更新日 令和2年3月19日