GEM Japan Cloud
概要
ゲノムデータや健康データの解析にクラウド環境を有効利用するために、クラウド環境下でデータ解析する際の標準的なアルゴリズム(ポータブルな(移植可能な)ワークフローの「定義」「共有」「実行」)を作成している。
具体的には、ワークフローの「定義」にはWorkflow Description Language(WDL)あるいはCommon Workflow Language(CWL)を使用することとし、ツールやワークフローを「共有」するためのTool Registry Service(TRS)、ワークフローやタスクを「実行」するためのWorkflow Execution Service (WES)およびTask Execution Service(TES)、さらにはデータアクセスのためのData Repository Service(DRS)の開発を進めている。
Tool Kit(2019年11月時点)
リリース済み
- Tool Registry Service (TRS) API v2
- Workflow Execution Service (WES) API v1
- Data Registry Service (DRS) API
作成中
- Task Execution Service (TES)
- Testbed & Interoperability Demonstration
参加メンバー
リード
- David Glazer:Verily Life Sciences、エンジニアリングディレクター
- Brian O’connor:UC Santa Cruz Genomics Institute、ディレクター
リンク
(記事協力:AMED科学技術調査員 秦千比呂)
掲載日 令和元年11月22日
最終更新日 令和元年11月22日