GEM Japan Cloud

概要

ゲノムデータや健康データの解析にクラウド環境を有効利用するために、クラウド環境下でデータ解析する際の標準的なアルゴリズム(ポータブルな(移植可能な)ワークフローの「定義」「共有」「実行」)を作成している。

具体的には、ワークフローの「定義」にはWorkflow Description Language(WDL)あるいはCommon Workflow Language(CWL)を使用することとし、ツールやワークフローを「共有」するためのTool Registry Service(TRS)、ワークフローやタスクを「実行」するためのWorkflow Execution Service (WES)およびTask Execution Service(TES)、さらにはデータアクセスのためのData Repository Service(DRS)の開発を進めている。

Tool Kit(2019年11月時点)

リリース済み

作成中

  • Task Execution Service (TES)
  • Testbed & Interoperability Demonstration

参加メンバー

リード

  • David Glazer:Verily Life Sciences、エンジニアリングディレクター
  • Brian O’connor:UC Santa Cruz Genomics Institute、ディレクター

リンク

(記事協力:AMED科学技術調査員 秦千比呂)

掲載日 令和元年11月22日

最終更新日 令和元年11月22日