健康・医療研究開発データ統合利活用プラットフォーム事業 AMEDデータ利活用プラットフォーム(CANNDs) CANNDsとは
概要
AMEDデータ利活用プラットフォーム(CANNDs)
AMEDデータ利活用プラットフォーム(CANNDs)は、健康・医療 分野におけるデータ連携の基盤として、AMED事業全体から生み出されたデータを格納する複数のデータベース等を連携し、横断検索機能を有するとともに、産業界も含めた研究開発にデータを扱う場(データを持ち込み扱えるセキュリティが担保されたVisiting利用環境)を広く提供します。
令和6年度は、3大バイオバンク(東北メディカル・メガバンク計画、ナショナルセンター・バイオバンクネットワーク、バイオバンク・ジャパン)の全ゲノムデータのメタデータの横断検索と、研究計画の立案を支援するアレル頻度情報の検索(連携基盤)、及び全ゲノムデータを処理する計算処理環境(連携拠点におけるシステム)、並びに遺伝型インピュテーションサービスを提供します。
メタデータの横断検索からデータの処理までワンストップで実行可能なサービスを提供することで、ゲノムデータ利活用を推進する役割を果たします。
令和6年度は、3大バイオバンクの全ゲノムデータのメタデータの横断検索、アレル頻度情報等を用いた研究計画の立案を可能とする連携基盤と、連携拠点におけるシステム(計算ノードとストレージ)によって構成されます。
連携基盤
AMEDが運用する「AMEDデータ利活用プラットフォーム」の一システムです。
「統合UI/UX(※1)」、「メタデータの横断検索」、「層別アレル頻度情報(※2)の閲覧」、「ID管理・連携」、「認証」等の機能を有します。
※1 UI:User Interface、UX:User Experience
※2 層別アレル頻度:データ提供機関より提供された全ゲノムデータセットを臨床基本4属性情報でグループ化した場合に、そのグループで観測される特定のアレルの出現頻度
連携拠点におけるシステム
個人情報にあたる全ゲノムデータを保管し、全ゲノムデータの統計処理ができる、「AMEDデータ利活用プラットフォーム」の情報システムです。
東京大学医科学研究所と東北大学東北メディカル・メガバンク機構は計算ノードとストレージを有します。国立健康危機管理研究機構はストレージのみを有します。
連携拠点一覧 ※五十音順
計算リソース
東京大学医科学研究所
ノード種類 | コア数 | メモリ | ノード数 |
---|---|---|---|
CPUノード | 48コア | 192Gb | 2ノード |
GPUノード | 128コア | 1Tb | 1ノード |
東北大学東北メディカル・メガバンク機構
ノード種類 | コア数 | メモリ | ノード数 |
---|---|---|---|
CPUノード | 128コア | 512Gb | 20ノード |
GPUノード | - | - | - |
最終更新日 令和7年6月26日