ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム（B-cure）（ゲノム医療実現推進プラットフォーム） AMEDゲノム制限共有データベース（AGD）
更新履歴
AMEDゲノム制限共有データベース（Amed Genome group sharing Database，以下、AGD）は、ゲノム医療研究におけるデータシェアリングを加速するための「制限共有※」を実現し、制限共有データを効率的・効果的に運用するための公的データベースです。ヒトゲノムデータの公開データベース（NBDCヒトデータベース、JGA・DRA等）を運用する DBCLS・DDBJの協力の下、構築・運用しています。AGD収録データは一定期間経過後には、制限公開（JGA）又は非制限公開（DRA等）への移行を原則としております。
| DBCLSの役割 | 登録・利用申請の受付け、登録データ審査および利用審査、AGD専用Webサイト運営（登録データ概要、ガイドライン等） |
|---|---|
| DDBJの役割 | 実際のデータベースの運用管理、技術支援 |
| AMEDの役割 | AGD全般に関する調整 |
#1 DBCLS：ライフサイエンス統合データベースセンター
#2 DDBJ：国立遺伝学研究所 DNA Data Bank of Japan
（参考資料）
NBDCヒトデータグループ共有ガイドライン
なお、AMEDでは、AMED との委託研究開発契約等に基づき実施される委託研究開発、補助事業その他 AMED が支援を行う事業によって創出、取得又は収集されたデータやそのデータを加工等することによって生み出されたデータに対して「AMED における研究開発データの取扱いに関する基本方針」を適用しております。 詳細につきましては、「AMED研究データ利活用に係るガイドライン」の最新版を参照ください。また、ゲノムデータに特化した内容は、同ガイドライン内末尾の「【ゲノム研究関連補足事項】」をも合わせて参照ください。
AGDに登録されている制限共有可能なデータ
（参考）
「制限公開データ※」はNBDCヒトデータベースに登録されています。
「非制限公開データ※」はNBDCヒトデータベース、MGeNDに登録されています。
（注）NBDCヒトデータベースでは、AMEDデータシェアリングポリシーに基づかないデータも含まれています。
※ 非制限公開、制限公開、制限共有データとは？
（※正確な定義は「AMEDデータシェアリングポリシー」をご参照ください。）- 非制限公開データ：アクセスに制限なく誰でも利用可能。データは公的データベースに登録。
- 制限公開データ：アクセス申請を承認された研究者が利用可能。データは公的データベースに登録。
- 制限共有データ：アクセス申請を承認された研究者間で共有。データはAGDや自機関データベース等に登録。
問い合わせ先
AGDのデータを利用した共同研究等にご関心がある場合は、AMEDゲノム・データ研究開発課または各データを登録した研究者までお問い合わせください。
ゲノム・データ基盤事業部 ゲノム・データ研究開発課TEL：03-6870-2228
E-mail：kiban-kenkyu”AT”amed.go.jp
※アドレスは”AT”の部分を@に変えてください。
AGD利活用手順
Ⅰ．制限共有データをAGDに登録する
1．事前相談
データの登録申請手続きについて、データ登録手順などを確認し、
ご不明な点があればDBCLSにご相談ください。
2．申請
- 申請者は、申請システム（https://gr-sharingdbs.ddbj.nig.ac.jp/nbdc/application/）から申請します。
- DBCLSに設置されたヒトデータ審査委員会が申請の審査をします。
- 審査承認後、DBCLSは申請者宛に承認通知、データ登録のためのSubmission ID、AGDへの登録手順の案内を送ります。
3．データ準備・登録
- 申請者は、登録するデータのメタデータを作成して、DDBJ指定の登録手順にしたがってアップロードします。
- 申請者は、登録するデータファイルを準備します。
- 申請者は、DDBJ指定の登録手順にしたがってデータファイルをアップロードします。
- DDBJにて、アップロードされたデータおよびメタデータを確認後、申請者にAGD管理用IDを通知します。
Ⅱ．AGDの制限共有データを利用する
1．問い合わせ
- 利用希望者は、お問い合わせフォームに必要事項を記入してデータ提供者に送る。
- データ提供者は、データ利用を許可する場合は、お問い合わせフォームに署名して利用希望者に返却する。
2．利用環境確認・整備 利用希望者は、ガイドラインに従い、利用環境を確認する必要があります。
3．申請
- 利用希望者は、申請システム（https://humandbs.dbcls.jp/data-submission）から申請します。
- DBCLSに設置されたヒトデータ審査委員会が申請の審査をします。
- DBCLSから利用希望者宛に承認通知とアクセス方法を送ります。
4．データ利用
データ利用希望者は、AGDファイルサーバー上の申請ID名のディレクトリーにアクセスいただき、申請時に登録した「データセット復号用公開鍵」とセットの「秘密鍵」を指定し、ファイルをダウンロードします。
Ⅲ．AGDの制限共有データを公開データに移行する
制限共有データは論文化等のタイミングで公開を原則とし、本格的データシェアリングを行い、ゲノム医療研究の発展への貢献が期待されます。AGDは、DBCLS・DDBJにより運用されているため、簡単な手続き（"AGDからNBDCヒトデータベースへ移行"という手続き）で迅速な公開が可能です。公開を希望するAGD管理用IDをDBCLSまでお知らせください。
最終更新日 令和6年2月13日