AMEDデータ利活用プラットフォーム(CANNDs) CANNDsで出来ること


研究に利用できるデータがあるか確認したい

連携基盤で利用出来ます

  • 全ゲノムデータのメタデータを横断的に検索
  • 層別アレル頻度情報の閲覧

※3大バイオバンク(東北メディカル・メガバンク計画、ナショナルセンター・バイオバンクネットワーク、バイオバンク・ジャパン)、健康長寿社会の実現を目指した大規模認知症コホート研究

詳細なゲノムデータを閲覧・統計処理し、研究に利用したい

データ利用審査会での承認を受け、連携拠点におけるシステムで利用できます(調整中)
現在、利活用個人データ・連携拠点におけるシステムの利用申請受付を停止しています。

  • シークエンスデータ(FASTQファイル)
  • CRAMファイル
  • GVCFファイル
  • 全ゲノムデータに付随する臨床基本4属性情報(年齢、性別、居住地域または出生地域、疾患名および疾病コード(ICD-10))
  • 遺伝型インピュテーションサービス

ゲノム医療実現バイオバンク利活用プログラム(次世代医療基盤を支えるゲノム・オミックス解析)により創出された研究成果データを利活用したい

連携基盤上で、メタデータを横断的に検索できます

現在、メタデータの検索が出来る研究開発課題名は下記のとおりです。
AGDのデータを利用した共同研究等にご関心がある場合は、データ利活用・ライフコース研究開発事業部 次世代医療データ利活用推進課(下記)または各データを登録した研究者までお問い合わせください。

データ利活用・ライフコース研究開発事業部 次世代医療データ利活用推進課
担当:AGDサポート
E-mail:AGD_support”AT”amed.go.jp
※アドレスは”AT”の部分を@に変えてください。

関連リンク:
AMEDゲノム制限共有データベース(AGD) | 国立研究開発法人日本医療研究開発機構

(令和8年4月24日現在)
AGD研究題目 AGD登録者(機関) 疾患名 データ内容 AMED研究開発課題名 AMED研究開発代表者(機関)

OMICS解析による呼吸器疾患の病態メカニズムの解明

遠西 大輔(岡山大学) COPD 末梢血
・全ゲノム
末梢血以外
・全エクソーム(肺)
・RNA-seq(肺)
・メタゲノム(肺)
・空間トランスクリプトーム(肺)
・空間プロテオミクス(肺)

COPDの病態解明・新規治療開発のための空間解析を含むマルチオミックスデータベース構築(21tm0724603)

COPDの病態解明・新規治療開発のための空間シングルセル・マルチオミックスデータベース構築(22tm0724605)

遠西 大輔
(岡山大学)
疾患の解明・克服を目指した糖尿病・内分泌・代謝疾患のバイオリソースバンク構築
(MISSION-DM-ENDO)
植木 浩二郎(国立国際医療研究センター) 糖尿病 末梢血
・全ゲノム
・miRNA
末梢血以外
・メタゲノム(糞便)
・メタボローム(糞便)
マルチオミックス手法を用いた糖尿病および合併症の病態解明に関する研究開発(JP22tm0724606) 植木 浩二郎
(国立国際医療研究センター)
心房筋生検による心房細動基質の組織学的評価 山口 尊則(佐賀大学 心房細動 末梢血
・全ゲノム
全ゲノム解析と組織オミックス解析による心房細動の病態解明と精密医療(JP21tm0724601) 小室 一成
(東京大学)

最終更新日 令和8年5月11日