ゲノム・データ研究開発課 バイオバンク情報一覧（DNA）

【概要・特色】
バイオバンク・ジャパンは個人の遺伝情報に基づく医療（オーダーメイド医療）を実現するために2003年に構築された研究基盤です。51疾患の患者さん約26.7万人（約44.1万症例）から収集したサンプル、臨床情報を保管しています。2015年より連携機関（日本臨床腫瘍研究グループ、日本小児がん研究グループ、国立病院機構）ならびにその他の機関からの試料保管を開始しました。
ヒトの生体試料と関連する情報を体系的に管理。DNA保管庫：4℃±2℃を維持した保管庫に約200万本のチューブが収納可能、自動搬送装置を搭載。血清保管庫：-150℃を維持したタンク内に約330万本のチューブが収納可能。

【試料利用後の権利】
分譲としての利用の場合、研究機関には試料･情報の使用を認めます。一方、分譲した試料･情報の使用により生じた知的財産権については、全て研究機関に帰属するものとし、東京大学や本プロジェクトに関わる機関は一切の権利を主張しません。
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【概要・特色】
JCOG試験は、研究実施計画書で規定された、均一性の高い集団に対して一定の治療が行われ、一定の規準による有効性・安全性の評価がなされているだけでなく、JCOGデータセンターでデータクリーニング済みであり、臨床情報の質が高い。
バンキングされている試料は、これら臨床情報と紐付いている。またJCOG試験は大規模ランダム化試験が多く、試料および臨床情報を用いることにより予後因子、治療効果予測因子の探索が可能である。さらに試験横断的に同疾患/同薬剤に対する大規模研究の実施も可能である。
本連携バイオバンクに参加しているJCOG試験はこちら

【概要・特色】
本バイオバンクは、8万人の地域住民及び7万人の3世代家系からなる前向き一般住民コホートの検体とそれらの臨床情報、ゲノム・オミックス情報、解析結果を収納している複合バイオバンクであり、家系情報を用いた解析も可能である。試料のみならず上記各種情報も分譲可能であり、次世代シークエンサーをはじめとする生体試料の解析基盤を持たない研究者でも利用可能である。

【概要・特色】
NCBNは、全国6カ所の国立高度専門医療研究センター(ナショナルセンター：NC)のバイオバンクが保有する生体試料に付随する疾患名・問診情報などを、カタログデータとして集約し公開。これにより、以下に紹介されている6NCのローカル・バイオバンクにおけるコーディネーションを円滑化しています。

【概要・特色】
説明と同意に基づく倫理性が担保され、質の高い臨床情報・病理情報が付随しているバイオバンクを運営している。ヒトの組織バンクとしては我が国最大規模である。科学的に価値があり患者に不利益を及ぼさない適切な採取部位を日本病理学会病理専門医が判断しており、試料の質が高いこと、あらゆる研究ニーズに応える悉皆的収集を行っていることが特徴である。

【概要・特色】
国循バイオバンクでは国循病院を受診された方を主な対象として、NCVCバイオバンクへの協力を呼びかけ、同意を取得している。患者血液検体からは、血清、血漿、DNA、生細胞を凍結保管し、臨床情報に加えて同意取得時の主病名、併存病名の登録も行っている。

【概要・特色】
・アルツハイマー病などの神経変性疾患に加え、健常対照(400以上)、精神疾患(1000以上)の脳脊髄液を収集
・精神疾患の重症度評価(PANSS, MADRS)、アルツハイマー病の髄液マーカー(pTau, Aβ42)、遺伝子解析データなどを含む付随情報が利用可能
・企業(60件以上)、海外(9件)などを含む250件以上の利用実績（殆どの試料は有償分譲可能）

【概要・特色】
高度総合医療を掲げるNCGMの特長を生かすべく、感染症のほか、多様な検体を収集しています。特に、エイズ治療・研究開発センター（ACC）と肝炎免疫研究センターでは、継時的な試料収集を行っています。
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【概要・特色】
成育バイオバンクは、成育疾患(胎児、新生児、小児、妊婦の疾患)を主に対象としている。患者(患児)に加え、両親等の試料を収集し、センターを受診している症例であれば最新の臨床情報と共に提供可能。また、特に希少疾患・難病中心に、遺伝子配列情報の統合データベースの構築を他の医療機関と連携して進めている。

【概要・特色】
高齢社会で懸念される認知症等の研究に資する、老年病領域に特化した国内唯一のバイオバンクである。特に老化と深い関係にある認知症や骨・関節疾患の患者ゲノム解析情報をはじめとした種々のオミックス解析情報も蓄積している。また、地域住民を対象としたコホート研究に参加する健常高齢者の試料・情報もバイオバンクに預託されており、それらは第三者の医学研究にも分譲することが可能。

【概要・特色】
バイオバンク信州は2019年より信州大学医学部附属病院の患者を対象に包括的同意に基づいたバイオバンク事業を実施している。検体としては患者末梢血由来検体（DNA、cfDNA、RNA、血清）、各種がん組織由来検体（凍結試料、DNA、RNA、初代培養株）などが保存管理されている。特色としては、バイオバンク担当者が手術室まで出向き検体回収を実施しているため、摘出後速やかにRNA抽出が行われ、非常にクオリティの高いRNA試料を保管している。分譲により、学外のアカデミア、企業でも研究利用が可能である。

【概要・特色】
国内において難病を含む疾病の遺伝的背景の研究のため、様々な疾病由来のDNAが収集されている。当バンクが保有する健常な日本人由来DNAは、各種疾病患者由来DNAの対照試料として有用です。2002年の分譲開始より現在までに延べ約47,000試料を分譲し、多数の産官学の研究機関により主に多型解析研究に利用され、研究成果が報告されています。

【概要・特色】
東京医科歯科大学では平成24年度より医歯両学部附属病院の外来通院、入院患者を対象に包括的同意に基づいたバイオバンク事業を実施している。患者末梢血DNA、血清、血漿、各種がんの外科手術標本凍結試料、組織マイクロアレイ用FFPEなどが保存管理されている。当該バイオリソースセンター情報サーバーには、詳細な臨床情報が患者氏名等を削除のうえ、病院電子カルテよりリアルタイムに転送されており、該当症例バイオリソースの保存の有無の検索システムも完備されている。手続きを経ることで学内外研究機関への分譲にも対応可能となっている。

【概要・特色】
・検体に電子カルテやがん登録情報などの臨床情報が付随している。
・温度管理モニタリング、各種ログ記録やDIN/RIN測定による品質管理が担保されている。
・匿名化されたサンプルは二次元バーコードチューブにて管理している。

【概要・特色】
大阪医科薬科大学付属病院における手術検体を診療科横断的に統合してストック管理している。
DNA、RNA抽出した状態での管理、Tissue Microarrayを作製した状態での保管を併せて施行している。
電子パンフレット

【概要・特色】
当バンクは2021年6月から外科（胃癌、大腸癌、肝臓癌、すい臓癌、胆管癌）、乳腺外科（乳癌）の手術検体を研究材料として保管・提供できるシステムを始動させました。続けて肺胸部系癌、婦人科系癌、泌尿器科系癌の採取を追加して現在運用中です。 患者さんにご提供いただくのは、手術・検査の際に摘出され、診断に使用された後の残余の試料（血液、組織、細胞、体液）です。バイオバンクのために別途、試料を摘出することはありません。検体は液体窒素液相保管（マイナス196度）、ディープフリーザー（マイナス80度）で厳重に保管しています。

【概要・特色】
他の地域とは遺伝背景の異なる琉球列島出身者を対象とした特徴あるバイオバンクです。祖父母の出生地調査から得られた信頼性の高い出身地情報をもとに行った解析により琉球諸島内でも地域による遺伝背景の違いが明らかになっています。琉球諸島特有のバリアントも多く存在し、他の地域では得ることのできない疾患関連ゲノム情報の同定が期待できる資源と考えられます。

【概要・特色】
北大病院の電子カルテシステムと連携した＜保管支援機能＞に加え、高品質の核酸抽出や核酸品質確認、次世代シークエンサー、病理標本作製、レーザーマイクロダイセクションなどを用いた＜解析支援機能＞を持つ。さらに研究遂行のための＜研究計画支援機能＞も有し、"貯める"だけではなく、"使用する"ことを目的としたオンデマンド型のバイオバンクである。設立後9年間の実績として、計77件の臨床研究支援を行い、2023年3月現在、61件の臨床研究支援、12件の企業との共同研究を行っている。北大病院内の21診療科との連携を行い、院外の多施設共同研究の検体管理も実施している。

【概要・特色】
地域住民を対象として、栄養や心理社会要因などを含めた生活習慣について、疾患発生・健康寿命の延伸に関連する要因を明らかにする。また、収集試料を用いて、ゲノム網羅的 SNP解析、リシークエンシング等による次世代分子疫学的コホート解析を実施する。さらに、生活習慣・環境要因 と相関する候補遺伝子多型解析など、地域住民集団の大規模サンプルにおけるゲノム解析を実施する。

【概要・特色】
2021年4月に新設された東大病院バイオリソースセンターでは同院でがんなどの治療を受けられている患者さんの生体試料および診療情報を収集、保管しています。
がんおよび正常組織のペア凍結検体、血漿、白血球由来のDNAを臓器横断的に保存しています。

【概要・特色】
医学に関わる研究のため、診療後の余剰試料である凍結組織や、パラフィンブロック、研究用採血血液（DNA、血清、血漿）と、それらに付随する臨床情報・予後情報を収集している。悪性腫瘍に特化した臓器横断的バイオバンク。病院併設の利点を生かし、治療前後の生体試料の収集と経時的な臨床データの活用を可能とした新しいバイオバンクを目指している。

【概要・特色】
1996年に発足した長期継続バンクです。
当院において検査・治療を受けた患者さんからの残余検体（凍結組織、血清）を凍結保存しますが、治療前の初診時血清や希少がん検体が含まれます。また、当研究所実施の健常者コホート研究で採取された検体（血しょう）が、同一地域における対照群（がんの病歴を持たない群）として利用できます。
最近ではがん組織の初代培養も実施している症例もあり、オミックス解析の結果を、元の患者細胞を用いて評価することができます。

【概要・特色】
臨床情報、疫学情報、生殖細胞系遺伝子変異に関する同意が得られており、特にがんに関して多彩な研究を展開することが可能。
また、非がん健常者を対象とした研究を実施することが可能である。
10,000名以上の対象者に対して全ゲノムスキャンを実施しており、共同研究の枠組みで利用が可能である。
これまでにNature Genetics誌をはじめ数多くの大規模研究で成果を上げてきた疫学研究に基づく試料・資料群である。

【概要・特色】
主に一般集団を対象とした大規模コホート研究であり、特定の疾患を有しない参加者から提供された試料、データ、および追跡期間中にがんに罹患された方の試料、データを保存している。

【概要・特色】
試料と資料の質を重視した独自のバイオバンク事業を立ち上げ、当センターにて一元管理する質の高い生体試料を有効活用した学術研究、創薬研究、新規診断法・個別化医療等の開発研究を活性化させることを目的としている。対外的には、医師との協議や倫理委員会への申請書作成などをお手伝いし、医師と企業との「橋渡し」的な役割を担当する。

【概要・特色】
学内外の産業的利用を含む包括的同意と利活用時の倫理承認のFront Door形式同意取得、そして病院併設の利点を生かした治療前後の時系列の生体試料収集と時系列の臨床データのリンクを可能とした豊富な試料と診療データ（例えば化学療法を受ける患者の場合、治療開始前に加えて、開始1, 3, 5, 12ヶ月後にも血液の採取）に加えて、同意取得・採取計画作成・試料採取・前処理・保管・払出を一元的の管理する仕組みとその配下で全自動血漿分離・DNA抽出・保管を担うロボットの開発導入による世界品質水準（ISBER)準拠の品質を保有している。

【概要・特色】
京都大学医学研究科が総力を結集して取り組むコホート研究であり、多彩な臨床情報を有している。これら臨床情報と、ゲノム・オミックス解析によって得られた生体分子の網羅的情報を統合解析することで、ヒトバイオロジーの包括的理解を目指している。

【概要・特色】
検体ストックはロボット倉庫で、臨床情報は電子カルテから検査データや投薬情報を一元的に抽出し表示するプログラムとバイオバンクを連結し、保存検体の搬出は電子カルテ上の臨床情報を見ながら自動で排出する機能を持たせている、オリジナリティーのあるバイオバンクである。

【概要・特色】
原爆被爆者は放射線被曝線量の推定が可能な唯一のヒト集団であり、その疫学調査結果は放射線防御の国際基準の策定根拠になっている。本バイオバンクは乳腺、肺、結腸、胃、甲状腺など放射線との関連が示唆されている固形がんの新鮮試料を収集していて、人体放射線健康影響研究にとって貴重な財産である。

【概要・特色】
消化管がん生物学研究や臨床研究の基礎資源として2001年より集積してきた組織検体をもとに，2008年から本事業を開始し、2010年に当研究所組織バンクに継承し現在に至っている。組織検体を使用した主な研究業績は、2016年3月発刊のLabcab(理科研)14巻20頁に掲載されている。

【概要・特色】
世界でも貴重な、1万名規模の血漿・尿メタボロミクスおよびゲノムデータを有するコホート研究である。悉皆性の高い追跡調査を実施し、がん・循環器疾患等の罹患情報や健診データ等を2012年から毎年収集している他、経年メタボロミクスデータも測定している。

【概要・特色】
愛知県がんセンターに設置されたバイオバンクであるため、悪性腫瘍の試料と情報が主体であるが、全初診患者を対象としており、悪性腫瘍以外の試料と情報も保管している。
センター内にある個別化医療センターと連携して、トランスレーショナルリサーチも推進していく。

【概要・特色】
久山町研究は平均的日本人のサンプル集団である久山町の一般住民を対象とした世界で最も精度の高い前向き追跡（コホート）研究である（受診率 約70-80%、追跡率 99％、剖検率 約70%）。当法人は、この久山町研究の約5千人のサンプルデータを管理している。