ゲノム・データ研究開発課 バイオバンク情報一覧

【概要・特色】
バイオバンク・ジャパンは個人の遺伝情報に基づく医療（オーダーメイド医療）を実現するために2003年に構築された研究基盤です。51疾患の患者さん約26.7万人（約44.1万症例）から収集したサンプル、臨床情報を保管しています。2015年より連携機関（日本臨床腫瘍研究グループ、日本小児がん研究グループ、国立病院機構）ならびにその他の機関からの試料保管を開始しました。
ヒトの生体試料と関連する情報を体系的に管理。DNA保管庫：4℃±2℃を維持した保管庫に約200万本のチューブが収納可能、自動搬送装置を搭載。血清保管庫：-150℃を維持したタンク内に約330万本のチューブが収納可能。

【試料利用後の権利】
分譲としての利用の場合、研究機関には試料･情報の使用を認めます。一方、分譲した試料･情報の使用により生じた知的財産権については、全て研究機関に帰属するものとし、東京大学や本プロジェクトに関わる機関は一切の権利を主張しません。
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【概要・特色】
JCOG試験は、研究実施計画書で規定された、均一性の高い集団に対して一定の治療が行われ、一定の規準による有効性・安全性の評価がなされているだけでなく、JCOGデータセンターでデータクリーニング済みであり、臨床情報の質が高い。
バンキングされている試料は、これら臨床情報と紐付いている。またJCOG試験は大規模ランダム化試験が多く、試料および臨床情報を用いることにより予後因子、治療効果予測因子の探索が可能である。さらに試験横断的に同疾患/同薬剤に対する大規模研究の実施も可能である。
本連携バイオバンクに参加しているJCOG試験はこちら

【概要・特色】
本バイオバンクは、8万人の地域住民及び7万人の3世代家系からなる前向き一般住民コホートの検体とそれらの臨床情報、ゲノム・オミックス情報、解析結果を収納している複合バイオバンクであり、家系情報を用いた解析も可能である。試料のみならず上記各種情報も分譲可能であり、次世代シークエンサーをはじめとする生体試料の解析基盤を持たない研究者でも利用可能である。

【概要・特色】
NCBNは、全国6カ所の国立高度専門医療研究センター(ナショナルセンター：NC)のバイオバンクが保有する生体試料に付随する疾患名・問診情報などを、カタログデータとして集約し公開。これにより、以下に紹介されている6NCのローカル・バイオバンクにおけるコーディネーションを円滑化しています。 

【概要・特色】
説明と同意に基づく倫理性が担保され、質の高い臨床情報・病理情報が付随しているバイオバンクを運営している。ヒトの組織バンクとしては我が国最大規模である。科学的に価値があり患者に不利益を及ぼさない適切な採取部位を日本病理学会病理専門医が判断しており、試料の質が高いこと、あらゆる研究ニーズに応える悉皆的収集を行っていることが特徴である。

【概要・特色】
国循バイオバンクでは国循病院を受診された方を主な対象として、NCVCバイオバンクへの協力を呼びかけ、同意を取得している。患者血液検体からは、血清、血漿、DNA、生細胞を凍結保管し、臨床情報に加えて同意取得時の主病名、併存病名の登録も行っている。

【概要・特色】
・アルツハイマー病などの神経変性疾患に加え、健常対照(400以上)、精神疾患(1000以上)の脳脊髄液を収集
・精神疾患の重症度評価(PANSS, MADRS)、アルツハイマー病の髄液マーカー(pTau, Aβ42)、遺伝子解析データなどを含む付随情報が利用可能
・企業(60件以上)、海外(9件)などを含む250件以上の利用実績（殆どの試料は有償分譲可能）

【概要・特色】
高度総合医療を掲げるNCGMの特長を生かすべく、感染症のほか、多様な検体を収集しています。特に、エイズ治療・研究開発センター（ACC）と肝炎免疫研究センターでは、継時的な試料収集を行っています。
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【概要・特色】
成育バイオバンクは、成育疾患(胎児、新生児、小児、妊婦の疾患)を主に対象としている。患者(患児)に加え、両親等の試料を収集し、センターを受診している症例であれば最新の臨床情報と共に提供可能。また、特に希少疾患・難病中心に、遺伝子配列情報の統合データベースの構築を他の医療機関と連携して進めている。

【概要・特色】
高齢社会で懸念される認知症等の研究に資する、老年病領域に特化した国内唯一のバイオバンクである。特に老化と深い関係にある認知症や骨・関節疾患の患者ゲノム解析情報をはじめとした種々のオミックス解析情報も蓄積している。また、地域住民を対象としたコホート研究に参加する健常高齢者の試料・情報もバイオバンクに預託されており、それらは第三者の医学研究にも分譲することが可能。

【概要・特色】
ヒト臍帯血幹細胞は、最も未分化な造血幹細胞を豊富に含むとともに、間葉系細胞などを含むことが知られています。臨床的には白血病などの難治性血液疾患に造血幹細胞移植の細胞源として利用されていますが、再生医療、創薬研究、免疫学研究、感染症研究、遺伝学研究、環境医学研究など広く医学研究や生物学研究でも利用が進められています。
本事業では、臨床用の公的臍帯血バンクの保存基準を満たさない臍帯血で、本事業への提供の同意書を取得できたものについて譲渡を受け、東京大学医科学研究所で細胞調製後に凍結保存したものを、理化学研究所バイオリソースセンターを通じて、再生医療や創薬などを始めとした医学発展を目指した基礎研究やトランスレーショナル研究を行う産学の研究者に提供しています。

【概要・特色】
研究支援施設として、学外研究者も細胞株分譲を利用できる（一部制限有）。細胞材料は口腔扁平上皮がん細胞などを収集し、海外からの分譲依頼にも応じている。その他、EBV細胞株樹立化も実施し、学内、学外から多数受託している。

【概要・特色】
ヒト疾患特異的iPS細胞に関しては、国内唯一のバンク機関として、同細胞の整備・提供を実施している。

【概要・特色】
1. 企業への分譲も可能
2. 共同研究契約の締結は必要なし
3. 成果物に対する帰属権は要求しない

【概要・特色】
バイオバンク信州は2019年より信州大学医学部附属病院の患者を対象に包括的同意に基づいたバイオバンク事業を実施している。検体としては患者末梢血由来検体（DNA、cfDNA、RNA、血清）、各種がん組織由来検体（凍結試料、DNA、RNA、初代培養株）などが保存管理されている。特色としては、バイオバンク担当者が手術室まで出向き検体回収を実施しているため、摘出後速やかにRNA抽出が行われ、非常にクオリティの高いRNA試料を保管している。分譲により、学外のアカデミア、企業でも研究利用が可能である。

信州大学医学部附属病院・臨床検査部・バイオバンク信州事務局
《E-mail》
biobank_shinshu"AT"shinshu-u.ac.jp

【概要・特色】
細胞は、GCTPを参考にCPCを利用して調製されるため全工程のトレーサビリティが確保され、無血清培地の使用により将来の同種細胞治療への応用を見据えた均一で高品質を特徴とする。非臨床研究用に加え、今後治験や臨床研究での利用を想定した細胞の供給を開始し、アカデミアのみならず、企業にも非臨床研究から臨床応用まで一貫した研究の実施を可能にする。

【概要・特色】
国内で最初に一般の研究機関が利用可能な日本人由来試料の分譲システムを確立した公的バンクです。2001年の分譲開始より利用数が増加し、現在までに約950試料を分譲しました。近年は新鮮組織及び新鮮組織より調製した凍結細胞の利用が増加しています。今後は需要に応じて資源の種類を充実させ、特に凍結細胞については機能面での性状情報を充実させて利用価値の高い高品質なヒト試料の供給を目指します。

【概要・特色】
国内において難病を含む疾病の遺伝的背景の研究のため、様々な疾病由来のDNAが収集されている。当バンクが保有する健常な日本人由来DNAは、各種疾病患者由来DNAの対照試料として有用です。2002年の分譲開始より現在までに延べ約47,000試料を分譲し、多数の産官学の研究機関により主に多型解析研究に利用され、研究成果が報告されています。

【概要・特色】
高品質な細胞資源を提供することに力を入れており、微生物、マイコプラズマ、ウイルス等の検査結果を細胞情報として提供している。また、染色体解析等のゲノム解析情報に関しても積極的に細胞に付加して情報提供を行っている。さらに細胞が増殖する改訂を動画にて情報提供している。

【概要・特色】
従来、難治性の眼表面疾患の有効な治療法の一つである羊膜移植術が先進医療として行われてきたが、2014年4月１日より保険収載されたことに伴い、羊膜移植に用いられる羊膜は日本組織移植学会に認定された羊膜バンクが供給することとなった。愛媛大学附属病院では、羊膜を採取、保存し、他施設にも供給可能である「愛媛大学医学部附属病院羊膜バンク」を平成２７年８月に設立した。
愛媛大学医学部附属病院羊膜バンクでは、全国の難治性眼表面疾患の患者さんが安心して羊膜移植を受けられるように、羊膜移植実施認定施設に安定して羊膜を供給している。

【概要・特色】
可移植性腹水癌細胞株をはじめ、種々のヒト癌細胞株、動物腫瘍細胞株、ハイブリドーマなどを利用者へ提供している。マイコプラズマ検査、STR検査、動物種同定検査などを行い、細胞株の品質管理も行っている。

【概要・特色】
間葉系細胞(MSC)は、炎症部位や組織障害部位に集積し、抗炎症・免疫抑制能と組織修復能を有しています。臍帯には豊富なMSCが含まれており、基礎から臨床研究へと幅広く利用されつつあります。なお、臍帯と同じドナーの臍帯血も提供可能です。

【概要・特色】
東京医科歯科大学では平成24年度より医歯両学部附属病院の外来通院、入院患者を対象に包括的同意に基づいたバイオバンク事業を実施している。患者末梢血DNA、血清、血漿、各種がんの外科手術標本凍結試料、組織マイクロアレイ用FFPEなどが保存管理されている。当該バイオリソースセンター情報サーバーには、詳細な臨床情報が患者氏名等を削除のうえ、病院電子カルテよりリアルタイムに転送されており、該当症例バイオリソースの保存の有無の検索システムも完備されている。手続きを経ることで学内外研究機関への分譲にも対応可能となっている。

【概要・特色】
横浜市立大学附属病院バイオバンクは、医学部・病院併設の利点を活かし、担がん患者、がん以外の疾患の患者の組織・血清・血漿のみならず、健常者の血清まで幅広く収集して保管しています。
がん組織検体と手術前後の血漿を一患者試料として採取を開始しました。
学外のアカデミアや企業への分譲、共同研究を通してトランスレーショナルリサーチの推進に取り組んでいます。

【概要・特色】
全参加者について、生殖細胞系列のゲノム解析の同意が取得された採血が保存されている。アンケートはJPHC-NEXTに千葉県独自の項目を追加している。市原市は東京を通勤圏内とする半島にあるため、都市型と地方型の双方の住民が参加している。

【概要・特色】
・検体に電子カルテやがん登録情報などの臨床情報が付随している。
・温度管理モニタリング、各種ログ記録やDIN/RIN測定による品質管理が担保されている。
・匿名化されたサンプルは二次元バーコードチューブにて管理している。

【概要・特色】
研究基盤の形成のため、主に腫瘍組織、血漿等の保管・管理を目的としたバイオバンクを設立しました。
がん患者さんの血漿については、術前・術後（１日以内）・術後1週間の血漿の保存を予定しています。

【概要・特色】
大阪医科薬科大学付属病院における手術検体を診療科横断的に統合してストック管理している。
DNA、RNA抽出した状態での管理、Tissue Microarrayを作製した状態での保管を併せて施行している。
電子パンフレット

【概要・特色】
まだまだ検体数は少ないが癌、腎・神経疾患等の検体を有している。バイオバンク用の計画書を作成し当院の倫理委員会の承認を得ている。さらに試料提供者からの書面による同意を得ているため、共同研究だけではなく分譲も可能である。検体には臨床情報が紐づき、利用価値が高いものとなっている。

【概要・特色】
悪性腫瘍に特化したバイオバンクです。腫瘍組織は摘出後ただちにRNA laterに浸漬し、その後-80℃保存しています。提供希望の方のニーズ（がん種、試料種、保存方法　等）に柔軟に対応するオンデマンド型バイオバンクです。研究部内での研究・解析が可能な「院外共同研究員」制度もあります。

【概要・特色】
岡山大学病院バイオバンクは大学病院内に設置されたバイオバンクであることから、様々なニーズへ柔軟に対応することが可能。具体的には(1)多様な疾患への対応が可能、(2)前向き検体採取やSOP以外の処理プロトコルへの対応が可能、(3)豊富な臨床情報を提供させて頂くことが可能、(4)所有する解析機器(マルチプレックスイムノアッセイ装置など)を用いた受託解析が実施可能、(5)院内の臨床研究・治験支援機能(ARO)との連携による付随研究やリバース・トランスレーショナル・リサーチの支援が可能、といった特徴を有する。

【概要・特色】
当バンクは2021年6月から外科（胃癌、大腸癌、肝臓癌、すい臓癌、胆管癌）、乳腺外科（乳癌）の手術検体を研究材料として保管・提供できるシステムを始動させました。続けて肺胸部系癌、婦人科系癌、泌尿器科系癌の採取を追加して現在運用中です。 患者さんにご提供いただくのは、手術・検査の際に摘出され、診断に使用された後の残余の試料（血液、組織、細胞、体液）です。バイオバンクのために別途、試料を摘出することはありません。検体は液体窒素液相保管（マイナス196度）、ディープフリーザー（マイナス80度）で厳重に保管しています。

【概要・特色】
他の地域とは遺伝背景の異なる琉球列島出身者を対象とした特徴あるバイオバンクです。祖父母の出生地調査から得られた信頼性の高い出身地情報をもとに行った解析により琉球諸島内でも地域による遺伝背景の違いが明らかになっています。琉球諸島特有のバリアントも多く存在し、他の地域では得ることのできない疾患関連ゲノム情報の同定が期待できる資源と考えられます。

【概要・特色】
北大病院の電子カルテシステムと連携した＜保管支援機能＞に加え、高品質の核酸抽出や核酸品質確認、次世代シークエンサー、病理標本作製、レーザーマイクロダイセクションなどを用いた＜解析支援機能＞を持つ。さらに研究遂行のための＜研究計画支援機能＞も有し、"貯める"だけではなく、"使用する"ことを目的としたオンデマンド型のバイオバンクである。設立後9年間の実績として、計77件の臨床研究支援を行い、2023年3月現在、61件の臨床研究支援、12件の企業との共同研究を行っている。北大病院内の21診療科との連携を行い、院外の多施設共同研究の検体管理も実施している。

【概要・特色】
地域住民を対象として、栄養や心理社会要因などを含めた生活習慣について、疾患発生・健康寿命の延伸に関連する要因を明らかにする。また、収集試料を用いて、ゲノム網羅的 SNP解析、リシークエンシング等による次世代分子疫学的コホート解析を実施する。さらに、生活習慣・環境要因 と相関する候補遺伝子多型解析など、地域住民集団の大規模サンプルにおけるゲノム解析を実施する。

【概要・特色】
2021年4月に新設された東大病院バイオリソースセンターでは同院でがんなどの治療を受けられている患者さんの生体試料および診療情報を収集、保管しています。
がんおよび正常組織のペア凍結検体、血漿、白血球由来のDNAを臓器横断的に保存しています。

【概要・特色】
医学に関わる研究のため、診療後の余剰試料である凍結組織や、パラフィンブロック、研究用採血血液（DNA、血清、血漿）と、それらに付随する臨床情報・予後情報を収集している。悪性腫瘍に特化した臓器横断的バイオバンク。病院併設の利点を生かし、治療前後の生体試料の収集と経時的な臨床データの活用を可能とした新しいバイオバンクを目指している。

【概要・特色】
千葉大学クリニカルバイオバンクはアカデミア・企業の垣根をを超えたがん研究シーズ探索および診断・治療薬開発の推進を目的に構築されました。
試料の詳細な収集・保存記録ならびにがんの患者さんの診療情報が連結され、利用できるようになっております。

【概要・特色】
1996年に発足した長期継続バンクです。
当院において検査・治療を受けた患者さんからの残余検体（凍結組織、血清）を凍結保存しますが、治療前の初診時血清や希少がん検体が含まれます。また、当研究所実施の健常者コホート研究で採取された検体（血しょう）が、同一地域における対照群（がんの病歴を持たない群）として利用できます。
最近ではがん組織の初代培養も実施している症例もあり、オミックス解析の結果を、元の患者細胞を用いて評価することができます。

【概要・特色】
当バイオバンクでは出生コホートで得られたさまざまな生体試料を保存している。2つの出生コホートの一つは15歳まで、もう一つは40歳程度までフォローアップする計画である。血液や便などは母児のペアとして保存されている。母乳や便などは経時的に収集・保存している。保存されている試料はコホート調査のデータを共に解析に供することができる。

【概要・特色】
研究者が必要とする研究用試料(既存試料)の有無については、検体保管システムで検索し提供している。また、保存されている既存試料について疾患名又は検査結果などを検索することにより、研究計画を立案する時点でのご提供も可能である。また、研究用試料は診療検査機関である「つくばi-Laboratory有限責任事業組合」において、検査が完了した後に分注され、この時に匿名化処理を行うなど自動化されている。

【概要・特色】
試料と資料の質を重視した独自のバイオバンク事業を立ち上げ、当センターにて一元管理する質の高い生体試料を有効活用した学術研究、創薬研究、新規診断法・個別化医療等の開発研究を活性化させることを目的としている。対外的には、医師との協議や倫理委員会への申請書作成などをお手伝いし、医師と企業との「橋渡し」的な役割を担当する。

【概要・特色】
学内外の産業的利用を含む包括的同意と利活用時の倫理承認のFront Door形式同意取得、そして病院併設の利点を生かした治療前後の時系列の生体試料収集と時系列の臨床データのリンクを可能とした豊富な試料と診療データ（例えば化学療法を受ける患者の場合、治療開始前に加えて、開始1, 3, 5, 12ヶ月後にも血液の採取）に加えて、同意取得・採取計画作成・試料採取・前処理・保管・払出を一元的の管理する仕組みとその配下で全自動血漿分離・DNA抽出・保管を担うロボットの開発導入による世界品質水準（ISBER)準拠の品質を保有している。

【概要・特色】
京都大学医学研究科が総力を結集して取り組むコホート研究であり、多彩な臨床情報を有している。これら臨床情報と、ゲノム・オミックス解析によって得られた生体分子の網羅的情報を統合解析することで、ヒトバイオロジーの包括的理解を目指している。

【概要・特色】
神戸大学医学部附属病院 バイオリソースセンターは、臨床情報データベースと紐づいたヒト検体をアカデミア研究者や開発企業などが簡便に利活⽤出来る「クリニカル（病院併設型）バイオバンク」として、2019年4⽉に神⼾⼤学医学部附属病院国際がん医療・研究センター内に設立されました。当センターは、研究・開発におけるニーズを予め聞き取り、ニーズに沿ってヒト検体＋医療情報を収集していく「ニーズドリブン」型バイオバンクを指向しています。

【概要・特色】
検体ストックはロボット倉庫で、臨床情報は電子カルテから検査データや投薬情報を一元的に抽出し表示するプログラムとバイオバンクを連結し、保存検体の搬出は電子カルテ上の臨床情報を見ながら自動で排出する機能を持たせている、オリジナリティーのあるバイオバンクである。

【概要・特色】
原爆被爆者は放射線被曝線量の推定が可能な唯一のヒト集団であり、その疫学調査結果は放射線防御の国際基準の策定根拠になっている。本バイオバンクは乳腺、肺、結腸、胃、甲状腺など放射線との関連が示唆されている固形がんの新鮮試料を収集していて、人体放射線健康影響研究にとって貴重な財産である。

【概要・特色】
消化管がん生物学研究や臨床研究の基礎資源として2001年より集積してきた組織検体をもとに，2008年から本事業を開始し、2010年に当研究所組織バンクに継承し現在に至っている。組織検体を使用した主な研究業績は、2016年3月発刊のLabcab(理科研)14巻20頁に掲載されている。

【概要・特色】
尿検体は臨床検査の残余分を原則、全検体収集しているので、慢性疾患などでは同一患者の最大約５年間の尿検体(最大20検体ほど)が保存されていて、総数は国内外で最大規模の約13万検体数である。それらを使い、検査したい対象（タンパク質など）の経時変化を調べたり、ある疾患の治療前後の比較などができる。

【概要・特色】
日本初、統合失調症や双極性障害を中心とした精神疾患の系統的バンクです。当バンクの特徴は、当事者・家族の積極的参画による運営、インフォームド・コンセントによる当事者・健常者の生前登録等です。

【概要・特色】
世界でも貴重な、1万名規模の血漿・尿メタボロミクスおよびゲノムデータを有するコホート研究である。悉皆性の高い追跡調査を実施し、がん・循環器疾患等の罹患情報や健診データ等を2012年から毎年収集している他、経年メタボロミクスデータも測定している。

【概要・特色】
日本組織移植学会のガイドライン、「整形外科移植に関するガイドライン」および「冷凍ボーンバンクマニュアル」に則って、十分な検査･処理･保存によって安全性を確保しています。検査法が確立していない感染症に関してはご本人の海外渡航歴などを問診によって確認させていただき、病気移しを予防しています。骨組織は60℃10時間の加温処理、腱や靭帯は抗菌剤処理を行い、細菌培養検査を実施しています。骨･靭帯組織は超低温フリーザ（-70℃以下）で保存しています。

【概要・特色】
特定非営利活動法人 成人白血病治療共同研究機構（Japan Adult Leukemia Study Group，JALSG)は「多くの血液疾患で苦しむ人々を救う活動を推進する」という公益の観点から、質の高い多施設共同の臨床研究を推進するとともに、血液疾患に関する社会環境の改善に貢献することを理念とし活動しています。 

【概要・特色】
愛知県がんセンターに設置されたバイオバンクであるため、悪性腫瘍の試料と情報が主体であるが、全初診患者を対象としており、悪性腫瘍以外の試料と情報も保管している。
センター内にある個別化医療センターと連携して、トランスレーショナルリサーチも推進していく。

【概要・特色】
久山町研究は平均的日本人のサンプル集団である久山町の一般住民を対象とした世界で最も精度の高い前向き追跡（コホート）研究である（受診率 約70-80%、追跡率 99％、剖検率 約70%）。当法人は、この久山町研究の約5千人のサンプルデータを管理している。