GEM Japan Canadian Distributed Infrastructure for Genomics（CanDIG）
国（運営主体）
カナダ
目的・目標
プライバシーとセキュリティを確保しつつ、国内で分散管理されたゲノムデータを統合的に解析できるアプリケーション等のインフラを整備し、カナダにおける全国規模の研究を実現する。
概要
- カナダのゲノム研究の5つの拠点が中心となりインフラを構築。
- OpenID ConnectやKeycloakなどのユーザー認証のためのプロジェクトやGA4GHのAPIなどを活用し、各施設でデータ管理する完全な分散化（Decentralized）モデルを実現。
- データをコピーしたり取り出したりすることなく解析できる仕組み（Send Compute to Data）が装備されている。
現状・トピックス
- 2018年11月、CANARIE (Canadian Network for the Advancement of Research Industry and Education) がCanDIGの新しいプログラムCHORD (Canadian Health ‘Omics Repository, Distributed) へのファンディング（CanDIGを含めた9つのプロジェクト総額3.2百万カナダドル（約2.5億円））を決定。
- 2019年1月、EUとアフリカおよびカナダが連携して、三大陸間で国際的にデータ共有を行うためのインフラを構築するCINECA (Common Infrastructure for National Cohorts in Europe, Canada, and Africa) プロジェクトが発表された（2019年1月時点で11か国・13コホート・約1400万人のデータ）。CanDIGが開発したカナダ国内でのデータ共有の仕組みを活用することが期待されている。
- 2019年5月、カナダ国内のStrategic Innovation Fundの一つにカナダ健康データプラットフォーム構築プロジェクトDHDP (Digital Health and Discovery Platform) が選定された（最大49百万カナダドル（約38億円））。CanDIGはプライバシーやセキュリティ面で、DHDPプロジェクトの中で基本的な役割を果たすことが期待されている。
基本情報
経緯
- 2016年9月、 Canada Foundation for Innovation (CFI) が、Cyberinfrastructure Initiativeの一環としてSickKidsを中心に進めるCanDIGに1.9百万カナダドル（約1.5億円）のファンディングを決定（4年間のプロジェクト）した。
- 2017年10月、GA4GH New Strategic Planに合わせて発表されたドライバープロジェクトの一つに選定された。
参加団体
- SickKids Research Institute
- UHN, Princess Margaret Cancer Centre
- Canadian Centre for Computational Genomics (C3G)
- McGill University
- Jewish General Hospital
- Université de Sherbrooke
- Canada's Michael Smith Genome Sciences Centre
- Genome Canada
- Compute Canada
- CANARIE
GA4GHへの貢献
- Work Streams: Large Scale Genomics / Regulatory & Ethics / Data Security
- Tool kit: htsget / Breach Response Protocol
Champions
- Jonathan Dursi (CanDIG)
- Michael Brudno (University of Toronto)
- Steven Jones (BCGSC)
- Guillaume Bourque (McGill University)
対象疾患・領域
Rare Disease, Cancer, Complex Traits, Basic Biology
リンク
掲載日 令和元年8月30日
最終更新日 令和元年8月30日